Journal of Applied Biosciences (J. Appl. Biosci.) [ISSN 1997 - 5902]
Volume 38: 2551 - 2563. Published February 9, 2011.
Le flétrissement bactérien du riz au Niger: diversité pathologique d’isolats collectés sur les périmètres irrigués
Basso A, Onasanya A , Issaka S , Sido A.Y, Haougui A, Adam T, Séré Y , Saadou M
1 Institut National de la Recherche Agronomique du Niger (INRAN), BP. 60 Kollo (Niger) ; 2 Unité de Phytopathologie du Centre du Riz pour l’Afrique (WARDA), 01 BP. 2031 Cotonou (Bénin) ; 3 Faculté d’Agronomie, Université Abdou Moumouni, B.P. 10 960, Niamey, Niger.
*Auteur correspondant e-mail : y.sere@cgiar.org
ABSTRACT
Objectifs : Etablir la diversité pathologique d’isolats de Xanthomonas oryzae pv. oryzae et identifier les gènes de résistance efficaces au Niger.
Méthodologie et résultats : Vingt (20) isolats collectés dans 16 localités du Niger ont été confrontés à 15 lignées quasi-isogéniques reçues de l’IRRI et portant un ou plusieurs gènes de résistance connus ainsi que trois variétés parmi lesquelles deux sont utilisées comme donneur de résistance au Rice Yellow Mottle Virus. La méthode d’inoculation est celle décrite par Dardick et al. (2003). La sévérité a été évaluée 14 jours après inoculation. Les gènes Xa-1, Xa-4, Xa-7 et la combinaison des gènes xa-5/xa-13 se révèlent efficaces alors que les gènes xa-8, Xa-18 et les variétés PNA647F4-56, Gigante et TOG5681 se sont avérés sensibles. Le modèle AMMI (Additive Main Effect and Multiplicative Interaction) habituellement utilisé pour analyser les interactions Génotype x Environnement a été appliqué à l’étude des relations entres les isolats et les lignées isogéniques. Il a fait apparaître 2 pathotypes, le pathotype XNgP1 qui se subdivise en deux sous groupes et le pathotype XNgP2 qui se subdivise en trois sous groupes. Les lignées et variétés se subdivisent en 4 groupes : Résistant, moyennement résistant, moyennement sensible, et sensible. La structure des populations se résume à 2 grands pathotypes : quatre isolats attaquent la plupart des structures génétiques tandis que six autres sont dotés d’un spectre étroit.
Conclusion et application : Les gènes Xa-1, Xa-4, Xa-7 et la combinaison des gènes xa-5/xa-13 se révèlent efficaces et peuvent être déployés dans le cadre d’une stratégie de gestion durable de la maladie.
Mots-clés : Riz, flétrissement bactérien, Xanthomonas oryzae, diversité pathologique, résistance.
ABSTRACT
Objectives: To establish pathological diversity of Xanthomonas oryzae pv. oryzae isolates and identify resistance genes in host plant.
Methodology and results: Twenty (20) isolates were collected from 16 locations around Niger and inoculated on 15 near-isogenic lines received from IRRI and carrying one or more known resistance genes and three varieties of which two are used as donors of resistance to Rice Yellow Mottle Virus. The inoculation method used was as described by Dardick et al. (2003). The severity was assessed 14 days after inoculation. The genes Xa-1, Xa-4, Xa-7 and the combination of genes xa-5/xa-13 proved effective while genes xa-8, Xa-18 and varieties PNA647F4-56, Gigante and TOG5681 were sensitive.
The AMMI (Additive Main Effect and Multiplicative Interaction) model usually used to analyze genotype x environment interactions was applied to study the relationships between isolates and isogenic lines. It showed two pathotypes: pathotype XNgP1 which is divided into two subgroups and pathotype XNgP2 which is divided into three subgroups. The lines and varieties were divided into four groups, i.e. resistant, moderately resistant, moderately sensitive, and sensitive. The population structure resulted in two major pathotypes: four isolates attacking most of the genetic structures and six others having a narrow spectrum.
Conclusion and application: The genes Xa-1, Xa-4, Xa-7 and the combination of genes xa-5/xa-13 are effective and can be deployed as part of a strategy for sustainable management of the disease.
Key words: Rice, bacterial blight in Niger, Xanthomonas oryzae pv. oryzae isolates, pathological diversity, resistance genes.
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